Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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MINDY3Q9CV28 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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MINDY3Q9CV28 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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MINDY3Q9CV28 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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MINDY3Q9CV28 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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MINDY3Q9CV28 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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MINDY3Q9CV28 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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MINDY3Q9CV28 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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MINDY3Q9CV28 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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MINDY3Q9CV28 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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MINDY3Q9CV28 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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MINDY3Q9CV28 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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MINDY3Q9CV28 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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MINDY3Q9CV28 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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MINDY3Q9CV28 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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MINDY3Q9CV28 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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MINDY3Q9CV28 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MINDY3Q9CV28 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms