Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Fcf1Q9CTH6 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Fcf1Q9CTH6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Fcf1Q9CTH6 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Fcf1Q9CTH6 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcf1Q9CTH6 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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