Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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