Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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