Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Nicn1Q9CQM0 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Nicn1Q9CQM0 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Nicn1Q9CQM0 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Nicn1Q9CQM0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Nicn1Q9CQM0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Nicn1Q9CQM0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Nicn1Q9CQM0 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Nicn1Q9CQM0 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Nicn1Q9CQM0 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Nicn1Q9CQM0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
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