Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms