Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Commd4Q9CQ02 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Commd4Q9CQ02 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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Commd4Q9CQ02 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Commd4Q9CQ02 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Commd4Q9CQ02 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Commd4Q9CQ02 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Commd4Q9CQ02 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Commd4Q9CQ02 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Commd4Q9CQ02 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Commd4Q9CQ02 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Commd4Q9CQ02 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Commd4Q9CQ02 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Commd4Q9CQ02 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Commd4Q9CQ02 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Commd4Q9CQ02 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Commd4Q9CQ02 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Commd4Q9CQ02 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Commd4Q9CQ02 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Commd4Q9CQ02 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Commd4Q9CQ02 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Commd4Q9CQ02 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Commd4Q9CQ02 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Commd4Q9CQ02 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Commd4Q9CQ02 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Commd4Q9CQ02 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Commd4Q9CQ02 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Commd4Q9CQ02 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Commd4Q9CQ02 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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