Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms