Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms