Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms