Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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