Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc8b1Q925Q3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc8b1Q925Q3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Slc8b1Q925Q3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc8b1Q925Q3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc8b1Q925Q3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Slc8b1Q925Q3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc8b1Q925Q3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc8b1Q925Q3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc8b1Q925Q3 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc8b1Q925Q3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc8b1Q925Q3 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc8b1Q925Q3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Slc8b1Q925Q3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Slc8b1Q925Q3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Slc8b1Q925Q3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Slc8b1Q925Q3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Slc8b1Q925Q3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Slc8b1Q925Q3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Slc8b1Q925Q3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Slc8b1Q925Q3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Slc8b1Q925Q3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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