Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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Dnajc28Q8VCE1 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Dnajc28Q8VCE1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Dnajc28Q8VCE1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Dnajc28Q8VCE1 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Dnajc28Q8VCE1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dnajc28Q8VCE1 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Dnajc28Q8VCE1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Dnajc28Q8VCE1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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Dnajc28Q8VCE1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Dnajc28Q8VCE1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Dnajc28Q8VCE1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Dnajc28Q8VCE1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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