Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r200Q8R281 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms