Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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MyripQ8K3I4 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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MyripQ8K3I4 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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MyripQ8K3I4 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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MyripQ8K3I4 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MyripQ8K3I4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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