Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Vrk3Q8K3G5 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Vrk3Q8K3G5 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms