Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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Abcf3Q8K268 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Abcf3Q8K268 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Abcf3Q8K268 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Abcf3Q8K268 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Abcf3Q8K268 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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