Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Nhlrc3Q8CCH2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Nhlrc3Q8CCH2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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