Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms