Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms