Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubash3bQ8BGG7 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms