Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms