Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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