Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.3Q85ZW6 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms