Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srgap3Q812A2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srgap3Q812A2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srgap3Q812A2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srgap3Q812A2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Srgap3Q812A2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Srgap3Q812A2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srgap3Q812A2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Srgap3Q812A2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Srgap3Q812A2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Srgap3Q812A2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms