Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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ChfrQ810L3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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ChfrQ810L3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
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ChfrQ810L3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms