Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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Amigo1Q80ZD8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Amigo1Q80ZD8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Amigo1Q80ZD8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Amigo1Q80ZD8 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Amigo1Q80ZD8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Amigo1Q80ZD8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Amigo1Q80ZD8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Amigo1Q80ZD8 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Amigo1Q80ZD8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Amigo1Q80ZD8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Amigo1Q80ZD8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Amigo1Q80ZD8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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