Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Zbed4Q80WQ9 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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Zbed4Q80WQ9 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Zbed4Q80WQ9 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Zbed4Q80WQ9 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Zbed4Q80WQ9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Zbed4Q80WQ9 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Zbed4Q80WQ9 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Zbed4Q80WQ9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Zbed4Q80WQ9 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Zbed4Q80WQ9 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zbed4Q80WQ9 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
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