Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ttc29Q80VM3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ttc29Q80VM3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ttc29Q80VM3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ttc29Q80VM3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc29Q80VM3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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