Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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