Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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