Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed3Q78IS1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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