Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms