Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Tmeff1Q6PFE7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Tmeff1Q6PFE7 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Tmeff1Q6PFE7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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Tmeff1Q6PFE7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Tmeff1Q6PFE7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Tmeff1Q6PFE7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tmeff1Q6PFE7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tmeff1Q6PFE7 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tmeff1Q6PFE7 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tmeff1Q6PFE7 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tmeff1Q6PFE7 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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