Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Usp49Q6P9L4 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Usp49Q6P9L4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Usp49Q6P9L4 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Usp49Q6P9L4 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Usp49Q6P9L4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Usp49Q6P9L4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Usp49Q6P9L4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp49Q6P9L4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp49Q6P9L4 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp49Q6P9L4 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp49Q6P9L4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms