Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC061212Q6P8K3 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms