Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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Tpm4Q6IRU2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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