Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms