Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sall3Q62255 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms