Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

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Length 993 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Sycp1Q62209 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sycp1Q62209 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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