Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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AtrxQ61687 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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AtrxQ61687 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AtrxQ61687 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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