Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
JrkQ60976 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
JrkQ60976 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
JrkQ60976 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
JrkQ60976 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
JrkQ60976 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms