Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms