Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Psmb6Q60692 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms