Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim38Q5SZ99 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim38Q5SZ99 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim38Q5SZ99 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim38Q5SZ99 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim38Q5SZ99 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim38Q5SZ99 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim38Q5SZ99 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Trim38Q5SZ99 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
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Trim38Q5SZ99 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim38Q5SZ99 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Trim38Q5SZ99 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim38Q5SZ99 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Trim38Q5SZ99 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim38Q5SZ99 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Trim38Q5SZ99 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim38Q5SZ99 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim38Q5SZ99 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim38Q5SZ99 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim38Q5SZ99 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim38Q5SZ99 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim38Q5SZ99 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Trim38Q5SZ99 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim38Q5SZ99 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim38Q5SZ99 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Trim38Q5SZ99 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Trim38Q5SZ99 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Trim38Q5SZ99 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Trim38Q5SZ99 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Trim38Q5SZ99 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Trim38Q5SZ99 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim38Q5SZ99 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim38Q5SZ99 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim38Q5SZ99 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim38Q5SZ99 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim38Q5SZ99 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim38Q5SZ99 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim38Q5SZ99 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim38Q5SZ99 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Trim38Q5SZ99 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim38Q5SZ99 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim38Q5SZ99 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim38Q5SZ99 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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