Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms