Protein–RNA interactions for Protein: Q4FJU9

Tmem40, Transmembrane protein 40, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem40Q4FJU9 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Tmem40Q4FJU9 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Tmem40Q4FJU9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Tmem40Q4FJU9 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Tmem40Q4FJU9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Tmem40Q4FJU9 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Tmem40Q4FJU9 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Gm37960-201ENSMUST00000192402 1897 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem40Q4FJU9 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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