Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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Lrrc43Q3V0L5 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Lrrc43Q3V0L5 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Lrrc43Q3V0L5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Lrrc43Q3V0L5 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Lrrc43Q3V0L5 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Lrrc43Q3V0L5 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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