Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Chpf2Q3UU43 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Chpf2Q3UU43 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Chpf2Q3UU43 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Chpf2Q3UU43 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms