Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms